Instalar y gestionar paquetes en R

Los paquetes de R permiten incrementar la capacidad de R: funciones, importación, exportación y manipulación de datos, gráficos, técnicas estadísticas, creación de informes etc. Son bibliotecas de código gratuitas creadas por la comunidad de usuarios y disponibles en varios repositorios como Comprehensive R Archive Network (CRAN) o Bioconductor.

CRAN Task Views ofrece un listado de paquetes ordenados por categoría: finanzas, genética, gráficos, series temporales, psicometría, etc. Bioconductor se centra en la bioinformática y el análisis de datos genómicos.

Hay dos modos de instalar y gestionar los paquetes en R:

Mediante código

En la consola escribimos:

install.packages("nombre del paquete") # Un paquete
install.packages(c("paquete1", "paquete2", "paquete3")) # Varios paquetes

R descargará e instalará los paquetes correspondientes. Para activarlos:

library("nombre del paquete") # O bien
require("nombre del paquete")

Para el funcionamiento de algunos paquetes es necesario que otros paquetes dependientes estén instalados. Normalmente R instala los paquetes dependientes necesarios. En caso contrario, nos dará error y tendremos que instalar manualmente esos paquetes requeridos.

Los paquetes son actualizados frecuentemente. Para actualizar todos:

update.packages()

Si queremos obtener la ruta de la carpeta que contiene los paquetes y una lista de los paquetes disponibles:

library() # Ruta y paquetes disponibles

# Adicionalmente:

search() # Lista los paquetes cargados
installed.packages # Proporciona más detalles sobre los paquetes
sessionInfo() # Información sobre R y paquetes cargados

Para obtener ayuda sobre un paquete:

?nombredelpaquete # Ejemplo: ?stats

Con RStudio

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En la anterior entrada, vimos como en RStudio tenemos una ventana donde poder gestionar los paquetes: instalar nuevos, cargar los descargados, actualizarlos o eliminarlos.

En la pestaña Packages en el cuadro inferior derecho (Ctrl+7) y clic Install packages. Buscamos el paquete deseado y clic sobre Install. O en la barra de herramientas: Tools > Install packages

Para activar, eliminar, buscar, actualizar o acceder a la ayuda:

Referencias

• Cargar paquetes automáticamente al inicializar R
• Instalación de R y RStudio
• Usando RStudio por primera vez
• Editando y ejecutando código en RStudio